Пользователь заходит на определённую страничку и запускается команда exec(....) так вот загвоздка в том что пока выполняется exec сайт как бы "висит" т.е. не листаются странички(браузер думает) для других пользователей, как только прекращается выполнение команды сайт становиться доступным. Как решить данную проблему? Для меня FreeBSD впервые...в гугле нечего не нашол

И при чем тут FreeBSD?????? что в exec выполняется? Может там загрузка на 100% и сервер просто не успевает отвечать на запросы.

exec('wget ....');
Добавлено спустя   3 минуты  1 секунду:
last pid:  8242;  load averages:  0.02,  0.01,  0.00    up 0+02:18:40  10:55:27
32 processes:  1 running, 31 sleeping
CPU:  0.0% user,  0.0% nice,  0.0% system,  0.0% interrupt,  100% idle
Mem: 55M Active, 421M Inact, 457M Free
Swap: 1024M Total, 1024M Free

  PID USERNAME  THR PRI NICE   SIZE    RES STATE   C   TIME   WCPU COMMAND
7994 wapstyle    1  45    0   119M 16004K piperd  7   0:00  0.00% httpd
7995 wapstyle    1  44    0 14180K  2728K nanslp  7   0:00  0.00% wget

100% нагрузки как я понял нет.

канал может забил на 100% своим wget'ом.
Добавлено спустя    28 секунд:
ограничь ему скорость скачивания

Вот именно стоит ограничение на скачивание всего 128kb а канал 10 мегабит. Прост фигня какая-то получается на CentOS могло запускать несколько копий например wget и одновременно можно было ползать по сайту, а тут если одну копию запустил всё жди пока закончит...

могу точно сказать что FreeBSD тут не при чем.